泛素-蛋白酶體是“消化”細胞內蛋白質(zhì)的重要途徑之一,它能調控多個(gè)重要的生命活動(dòng),如細胞增殖、分化、凋亡、DNA 修復等。近年來(lái),人們逐漸認識到泛素-蛋白酶體系統的異常與多種不同疾病的發(fā)生密切相關(guān),包括神經(jīng)退行性疾病阿爾茲海默癥、亨廷頓病、癌癥、心血管和呼吸系統疾病等。在神經(jīng)退行性疾病中,外源或者內源因素可以引發(fā)神經(jīng)細胞內外蛋白質(zhì)的錯誤折疊,從而影響泛素-蛋白酶體的降解功能而導致大量蛋白的異常堆積,甚至細胞死亡。而腫瘤的發(fā)生則與細胞過(guò)度增殖以及抗凋亡能力增強有關(guān)。泛素-蛋白酶體通過(guò)促進(jìn)抑癌蛋白如P53的降解或者阻滯致癌蛋白降解而影響腫瘤細胞的存活。在近幾十年的研究中,泛素-蛋白酶體作為一個(gè)龐大的蛋白質(zhì)機器,成為科學(xué)家們研發(fā)疾病潛在有效藥物的重要靶點(diǎn)。
泛素-蛋白酶體途徑作用機制
泛素-蛋白酶體途徑需要包括泛素(ubiquitin,Ub)、泛素激活酶 E1( ubiquitin-activating enzyme,E1)、泛素聚合酶(亦稱(chēng)泛素載體蛋白)(ubiquitin-carrier protein,E2)、泛素連接酶(ubiquitin-ligating enzyme,E3)、26S蛋白酶體(26S proteasomes)和去泛素化酶(deubiquitinating enzymes,DUBs)等相關(guān)物質(zhì)的參與。
泛素-蛋白酶體途徑由底物蛋白質(zhì)泛素化和底物通過(guò)蛋白酶體降解2個(gè)過(guò)程組成。泛素是一條由76個(gè)氨基酸組成的高度保守的多肽鏈。泛素通常以2種形式存在,一種是游離形式,另一種形式是與受體蛋白共價(jià)結合。泛素通過(guò)其C端與受體蛋白賴(lài)氨酸側鏈的ε-氨基或受體蛋白N端的α-氨基共價(jià)結合的過(guò)程稱(chēng)為泛素化。泛素化是一個(gè)由泛素激活酶 E1,泛素聚合酶E2 和泛素連接酶E3等介導的多酶級聯(lián)反應。
泛素激活酶E1在進(jìn)化中很保守,是一種 ATP 依賴(lài)的酶,通過(guò)與泛素的 C 端形成高能硫酯鍵而激活泛素。與E1不同,細胞內存在多種 E2。E2 與活化的泛素結合形成E2-泛素復合體,E2協(xié)助特異性 E3將活化的泛素轉移到底物。泛素連接酶 E3是泛素化反應系統中數量最大、結構最多樣、調控機制最為復雜的成員,它可以直接與底物或通過(guò)輔助蛋白與底物相互作用,從而決定泛素介導底物蛋白質(zhì)降解的選擇性。哺乳動(dòng)物細胞內的E3 主要有三大類(lèi),即含HECT( homologous to E6-AP C-terminal) 結構域的E3、含環(huán)指結構( RING finger)的E3、含U-box 的E3。E3在泛素化過(guò)程中的作用主要包括3個(gè)階段:E3與E2的相互識別與作用、E3 與底物蛋白質(zhì)的相互識別與作用、E3 催化泛素與底物蛋白質(zhì)的連接及泛素與泛素之間的連接。最終,泛素通過(guò)其C端與受體蛋白賴(lài)氨酸側鏈的ε-氨基發(fā)生共價(jià)結合,而這些泛素分子上的48位、63 位賴(lài)氨酸又可以作為修飾位點(diǎn),如此,底物蛋白上可以形成多泛素鏈。一般地,由48位賴(lài)氨酸殘基連接的4個(gè)或更多個(gè)泛素的底物蛋白質(zhì)可以被 26S 蛋白酶體識別并將其降解,而由63位賴(lài)氨酸殘基連接的泛素鏈則不參與蛋白質(zhì)的降解過(guò)程,其主要與細胞內信號轉導過(guò)程和 DNA 修復等相關(guān)。
泛素在泛素化修飾的底物蛋白質(zhì)被26S 蛋白酶體降解之前,可以被去泛素化酶( deubiquitinating enzyme,DUB) 水解脫離下來(lái),從而避免其與底物蛋白一道被降解,解離下來(lái)的游離形式的泛素可以被循環(huán)使用。蛋白酶體是一種巨大的具有四級結構的復合蛋白酶(約2000 kD),具有多種蛋白水解酶的活性,其蛋白降解功能主要依賴(lài)于泛素化過(guò)程。26S蛋白酶體由20S 核心復合物( core particle,CP) 和19S 調節復合物( regulatory particle,RP,也稱(chēng)PA700) 組成。其中,20S是由4個(gè)同軸的、7個(gè)亞基組成的七聚體環(huán)疊而成的中空桶裝結構。兩側外環(huán)由 αl-α7 亞單位組成,2 個(gè)內環(huán)由 β1-β7 亞單位組成。3 個(gè)組成型表達的β亞基( β1、β2、β5) 具有蘇氨酸蛋白酶活性位點(diǎn)(分別為“半胱天冬酶-樣”活性位點(diǎn)、“胰蛋白酶-樣”活性位點(diǎn)、“胰凝乳蛋白酶-樣”活性位點(diǎn)),且被封閉在降解腔的內側,從而有效阻止正常折疊的蛋白質(zhì)進(jìn)入降解腔。19S 調節復合物可以識別泛素化底物,去折疊底物并釋放游離形式的泛素,打開(kāi) α 環(huán)上的降解通道并將去折疊的底物送入降解腔。所以,泛素-蛋白酶體介導的迅速且不可逆的特異性蛋白質(zhì)降解是一個(gè)高度復雜、受到嚴格調控的生命過(guò)程。
泛素-蛋白酶體通路(來(lái)源文獻[1])
Ub:泛素;E1:泛素激活酶;E2:泛素載體蛋白;E3:泛素連接酶;DUB:去泛素化酶
泛素-蛋白酶體與藥物研發(fā)
目前已報道的多種人類(lèi)疾病與蛋白酶體通路的異常有關(guān)。經(jīng)批準的蛋白酶體抑制劑也已成功用于治療多發(fā)性骨髓瘤、套細胞淋巴瘤等癌癥,而正在開(kāi)發(fā)的多個(gè)靶向泛素-蛋白酶體通路不同組分的藥物,如去泛素化酶抑制劑等臨床前測試藥物,泛素化酶調節劑、新的蛋白酶體抑制劑等臨床試驗藥物等也顯現出更值得期待的療效。
1、蛋白酶體抑制劑
目前已報道的有較好抗腫瘤效果的藥物有10余種,且用于臨床治療的藥物以蛋白酶體抑制劑居多。硼替佐米(Bortezomib)Bortezomib (PS-341)是首 個(gè)被 FDA 批準的以泛素-蛋白酶體通路為靶點(diǎn)的蛋白酶體抑制劑類(lèi)藥物。Bortezomib 是一種硼酸二肽,它可以特異性地與20S蛋白酶體的β5亞基的蘇氨酸的活性部位結合,有效抑制胰凝乳蛋白酶活性。同時(shí),它也可以與 β1 亞基的蘇氨酸的活性部位結合,抑制半胱天冬蛋白酶活性。Bortezomib是一類(lèi)高選擇性的可逆抑制劑,也是一種被批準用于治療多發(fā)性骨髓瘤的藥物。暴露于 Bortezomib 可以穩定 p21,p27,p53蛋白以及促凋亡Bid和Bax 蛋白,阻斷細胞內 NF-κB 通路的激活,導致腫瘤細胞死亡。
Carfizomib 作為第二代蛋白酶體抑制劑類(lèi)藥物,于2012 年被 FDA 批準用于治療已經(jīng)使用過(guò)Bortezomib 治療的多發(fā)性骨髓瘤患者。與Bortezomib不同,Carfizomib 屬于環(huán)氧酮類(lèi)化合物,具有獨特的化學(xué)結構和選擇性,它的環(huán)氧酮部分與蘇氨酸的羥基和游離 α-氨基相互作用,以不可逆的方式形成嗎啉加合物。Carfizomib 與蛋白酶體其他 β 亞基如 β1、 β2 的結合能力要弱于 Bortezomib,從而降低了對胰蛋白酶、半胱天冬酶的活性抑制。 Ixazomib 是首 個(gè)被批準的口服硼酸酯類(lèi)蛋白酶體抑制劑。數據顯示,Ixazomib 可以以“孤兒藥”或者聯(lián)合其他蛋白酶體抑制劑給藥的方式,用于治療多發(fā)性骨髓瘤、全身性輕鏈淀粉樣變等其他惡性腫瘤。此外,蛋白酶體的特殊亞基類(lèi)抑制劑(β1i、β2i、β5i),也可通過(guò)與亞基的結合,以可逆或者不可逆的方式占據蛋白質(zhì)降解的結合位點(diǎn),抑制降解、阻滯細胞周期,從而有效抑制腫瘤的復發(fā)。
2、去泛素化酶抑制劑
去泛素化酶抑制劑作用于半胱氨酸蛋白酶和金屬蛋白酶?,F已開(kāi)發(fā)的與19S蛋白酶體相關(guān)的去泛素化酶主要有UCHL5 (or UCH37)、USP14、USP7和PSMD14 (POH1)等。P5091屬于噻吩類(lèi)小分子抑制劑,它與P22077主要作用于USP7。研究發(fā)現,對Bortezomib治療產(chǎn)生耐藥性的多發(fā)性骨髓瘤患者中使用P5091,可誘導腫瘤細胞的死亡。WP-1130、b-AP15均可作用于多個(gè)去泛素化酶。多泛素化修飾蛋白的累積阻滯細胞周期,從而有效抑制結腸癌等腫瘤的發(fā)展。WP-1130與Bortezomib有協(xié)同的腫瘤治療作用,而b-AP15更多用于治療耐Bortezomib藥性的腫瘤。作為金屬蛋白酶家族成員之一的去泛素化酶PSMD14,其在細胞內水平負調控多發(fā)骨髓瘤細胞的增殖以及患者的生存率,由此,Cleave Biosciences公司設計合成了針對PSMD14的特異性抑制劑并已進(jìn)入臨床試驗前期。
3、泛素化酶調節劑
E1是泛素化體系中的第一個(gè)酶。兩種E1 (Uba1和Uba6)調節了下游泛素化反應。因此,調控E1活性可調節下游某些與腫瘤相關(guān)蛋白的泛素化。目前,已有多種 E1 抑制劑被報道。例如,Uba1的抑制劑PYR-41 和PYZD-4409。但已進(jìn)入臨床試驗的只有類(lèi)泛素分子NEDD8 的E1活化酶抑制劑MLN4924。抑制E1會(huì )導致泛素化底物的累積,而 E1 較差的特異性和成藥性成為了發(fā)展 E1抑制劑的絆腳石。E2 抑制劑具有較強的選擇性,提供了在腫瘤治療方面更大的空間。如抑制劑CC0651 通過(guò)與CDC34 的結合而發(fā)生的構象改變阻滯了Ub 的級聯(lián)反應。E3的數量約有近700個(gè),它能夠特異性識別蛋白質(zhì)底物,從而使得它成為多種相關(guān)疾病的治療靶點(diǎn)。人們可以通過(guò)調控底物蛋白質(zhì)的 E3 來(lái)調節目的蛋白,從而有針對性地提高療效。如MDM2是腫瘤抑癌基因p53的E3,阻斷MDM2和p53 的相互作用,可以穩定 p53,從而阻滯腫瘤細胞周期,促進(jìn)凋亡。Nutlin-3 是第一個(gè)以 MDM2 為靶點(diǎn)的 E3 抑制劑。Nutlin-3模擬并占據 p53 與 MDM2 的結合位點(diǎn),從而避免 p53 被泛素標記而降解。作為另一種穩定 p53的小分子藥物,RITA 通過(guò)與 p53 的 N 端結合從而抑制 p53 與 MDM2 之間的相互作用。被批準用于治療多發(fā)性骨髓瘤(MM)、套細胞淋巴瘤(MCL)、骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndromes)的藥物
參考資料
[1]陳禹杉,姜天霞,周魯明,馮仁田,邱小波.泛素-蛋白酶體通路與藥物研發(fā)[J].中國生化藥物雜志,2016,36(12):1-6.
[2]劉揚.泛素-蛋白酶體與藥物應用[J].大學(xué)化學(xué),2019,34(07):60-66.
作者簡(jiǎn)介:小泥沙,食品科技工作者,現就職于國內某大型藥物研發(fā)公司,從事?tīng)I養食品及功能性食品的開(kāi)發(fā)與研究。
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