隨著(zhù)全球人口持續增長(cháng)、氣候變化日益加劇以及耕地資源不斷減少，如何保障糧食安全并實(shí)現農業(yè)的可持續發(fā)展，已成為當今世界面臨的重大挑戰。
2025 年 7 月 24 日，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所高彩霞研究員、華中農業(yè)大學(xué)李國田教授領(lǐng)銜的中外團隊在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Nature 上發(fā)表了題為：Integrated biotechnological and AI innovations for crop improvement 的綜述論文。
該綜述總結了多組學(xué)、基因組編輯、蛋白質(zhì)設計和高通量表型與人工智能（AI）在作物遺傳改良中的整合應用，并提出了一個(gè)由 AI 輔助的優(yōu)異作物種質(zhì)設計框架，為未來(lái)農業(yè)的可持續發(fā)展擘畫(huà)了清晰的路線(xiàn)圖。
論文首先闡述了現代組學(xué)技術(shù)是實(shí)現育種范式變革的基礎?；蚪M學(xué)、代謝組學(xué)以及單細胞組學(xué)等研究方向的興起，為我們提供了前所未有的能力去深入解析作物的遺傳信息和生命活動(dòng)規律，從而揭示更多可用于性狀精準改良的新位點(diǎn)。與此同時(shí)，高通量表型鑒定技術(shù)（HTP）利用無(wú)人機、傳感器和自動(dòng)化平臺，實(shí)現了對海量作物性狀數據的快速、精準評估，從而高效地連接了基因型與表型，為篩選優(yōu)良變異提供了關(guān)鍵支撐。
在此基礎上，論文詳細論述了實(shí)現作物改良的強大工具。以 CRISPR 為代表的基因組編輯技術(shù)，已能夠實(shí)現對作物基因組開(kāi)展高效、精準的定向修飾，其跨尺度、多維度的基因組設計能力將顯著(zhù)縮短育種周期，快速創(chuàng )造和聚合優(yōu)良性狀。不僅如此，AI 驅動(dòng)的蛋白質(zhì)設計技術(shù)正在興起，它能夠從頭創(chuàng )造出自然界中不存在的、具有特定功能的全新蛋白質(zhì)。這為開(kāi)發(fā)新型抗病蛋白、實(shí)時(shí)監測作物健康的生物傳感器或降解環(huán)境污染物的特制酶提供了可能，從而賦予作物突破性的新功能。
通過(guò)整合新技術(shù)促進(jìn)潛在作物改良
作物改良中的基因組編輯技術(shù)
作物改良中的蛋白質(zhì)設計
高通量表型鑒定技術(shù)加速作物改良
該綜述的核心亮點(diǎn)在于提出了一個(gè)"AI 輔助作物設計"的整合模型。這一前瞻性框架旨在利用 AI 的強大能力，整合并分析來(lái)自基因組、表型、環(huán)境和管理措施的多模態(tài)大數據。在該模型中，育種家可以設定具體的改良目標，例如提升產(chǎn)量、增強抗逆性或改善營(yíng)養品質(zhì)，AI 則通過(guò)深度學(xué)習與知識推理，生成一套最優(yōu)化的、包含具體技術(shù)路徑的綜合性育種方案。這種模式將作物育種從依賴(lài)經(jīng)驗的傳統方式，轉變?yōu)閿祿寗?dòng)的精準設計過(guò)程。
人工智能輔助作物設計的研究框架
最后，該綜述探討了新技術(shù)應用所面臨的挑戰和發(fā)展方向。作者指出，高質(zhì)量、標準化的數據是訓練 AI 模型的基礎，同時(shí)，新技術(shù)的應用也必須嚴格遵守生物安全和相關(guān)法規要求。令人鼓舞的是，全球范圍內對基因組編輯作物的監管政策正朝著(zhù)更為科學(xué)和簡(jiǎn)化的方向發(fā)展，這為新技術(shù)的廣泛應用創(chuàng )造了有利條件。
中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所高彩霞研究員和華中農業(yè)大學(xué)李國田教授為該論文的通訊作者。華中農業(yè)大學(xué)李國田教授、華中農業(yè)大學(xué)作物遺傳改良國家重點(diǎn)實(shí)驗室楊萬(wàn)能教授、華盛頓大學(xué)蛋白質(zhì)設計研究所 David Baker 實(shí)驗室 Linna An 博士、華中農業(yè)大學(xué)農業(yè)微生物資源發(fā)掘與利用全國重點(diǎn)實(shí)驗室楊磊博士為論文共同第一作者。華大生命科學(xué)研究院魏桐研究員、楊萬(wàn)能教授團隊博士后施家偉、博士研究生王江林、英國Aberystwyth大學(xué)國家植物表型組中心主任 John Doonan 教授、華中農業(yè)大學(xué)謝卡斌教授、德國馬克斯·普朗克分子植物生理研究所 Alisdair R. Fernie 教授、澳大利亞聯(lián)邦科工組織 Evans Lagudah 院士及美國亞利桑那大學(xué)基因組學(xué)研究所所長(cháng)、阿卜杜拉國王科技大學(xué) Rod A. Wing 教授參與論文撰寫(xiě)。
論文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09122-8
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