以連接組和空間轉錄組為代表的多組學(xué)研究已進(jìn)入單細胞分辨率時(shí)代,這需要具備單細胞水平空間定位能力的參考腦圖譜。然而,現有的腦圖譜都沒(méi)能做到單細胞可見(jiàn)的空間定位。
2025 年 7 月 2 日,海南大學(xué)/華中科技大學(xué)駱清銘院士、龔輝教授及加州大學(xué)洛杉磯分校董紅衛教授團隊(豐釗為第一作者)合作,在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Nature 上發(fā)表了題為:A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究論文。
該研究以 1 微米的各向同性分辨率繪制了小鼠三維腦區和立體定位圖譜,該圖譜可為大型腦圖譜項目提供數據分析和可視化支持,有望成為一種多功能腦科學(xué)工具,用于在單細胞水平上研究整個(gè)大腦。
在這項最新研究中,研究團隊通過(guò)連續微光學(xué)切片斷層成像技術(shù),以各向同性 1 微米的分辨率呈現了一套基于尼氏染色的小鼠全腦細胞結構數據集。
通過(guò)整合多模態(tài)圖像,研究團隊構建了小鼠大腦三維參考圖譜--STAM,提供了 916 個(gè)結構的三維形貌,并能夠生成任意角度的 1 微米分辨率切片圖像。研究團隊進(jìn)一步開(kāi)發(fā)了一個(gè)基于信息學(xué)的平臺,用于可視化和共享圖譜圖像,提供諸如腦切片配準、神經(jīng)元回路繪制和智能立體定向手術(shù)規劃等服務(wù)。該圖譜可與廣泛使用的立體定位圖譜兼容,支持在二維空間中對相應冠狀面進(jìn)行跨圖譜導航,并在三維空間中實(shí)現圖譜空間的跨圖譜空間映射。
通過(guò)為大型腦圖譜項目提供數據分析和可視化支持,該研究開(kāi)發(fā)的 STAM 圖譜有望成為一種多功能的腦科學(xué)工具,用于在單細胞水平上研究整個(gè)大腦。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09211-8
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