TGF-β信號通路在小鼠胚胎發(fā)育中扮演著(zhù)重要的角色,包括胚胎模式建立,細胞命運確定和動(dòng)態(tài)運動(dòng)等,并且還影響胚胎干細胞的多能性和分化功能。經(jīng)典的TGFβ信號傳導主要通過(guò)Smad2/3與Smad4形成的復合物激活下游的靶基因。然而,越來(lái)越多的研究表明,在某些情況下,Smad2/3可獨立于Smad4入核,并發(fā)揮調控作用。在小鼠胚胎發(fā)育早期,從上胚層中特異性敲除Smad4卻對于TGF-β掌控的上胚層的形成影響甚微。因此探究Smad2/3獨立于Smad4的調控機制尤為重要。
2024年11月22日,上海交通大學(xué)醫學(xué)院王瓊團隊聯(lián)合杜艷華和章永春團隊,在 Nature Communications 期刊發(fā)表了題為:A stepwise mode of TGFβ-SMAD signaling and DNA methylation regulates na?ve-to-primed pluripotency and differentiation 的研究論文。
該研究以小鼠胚胎干細胞(mESC)為模型,結合多組學(xué)數據和蛋白質(zhì)譜的方法,確定了Smad2/3通過(guò)依賴(lài)與非依賴(lài)Smad4的方式調控干細胞命運的不同發(fā)展階段,闡明了TGFβ-Smad信號通路與DNA甲基化等表觀(guān)遺傳修飾協(xié)同調控小鼠胚胎植入的發(fā)育機制,提出了一種胚胎干細胞在原始態(tài)-始發(fā)態(tài)-分化過(guò)程中的分步調控模型。
該研究提出了一種胚胎干細胞在原始態(tài)-始發(fā)態(tài)-分化過(guò)程中的分步調控模型。1)原始態(tài)(na?ve)到始發(fā)態(tài)(primed)的轉變:Smad2/3獨立于Smad4上調 Dnmt3b,一方面確保從頭DNA甲基化模式的建立,并通過(guò)甲基化Sox2等多能性因子來(lái)促進(jìn)干細胞從原始態(tài)逐步退出。另一方面,Dnmt3b能直接與Smad2/3互作并促進(jìn)Smad2/3結合到上胚層順式作用元件中心的低甲基化谷。2)中內胚層分化:上胚層通過(guò)原腸運動(dòng)分化為中內胚層譜系。從頭甲基化活動(dòng)減弱并伴隨Dnmt3b表達下調。Smad4取代Dnmt3b,接過(guò)TGFβ信號傳遞的“接力棒”,形成經(jīng)典的Smad2/3-Smad4轉錄復合物
圖1.干細胞在原始態(tài)-始發(fā)態(tài)-分化過(guò)程中的分步調控模型。首先,Smad2/3通過(guò)誘導 Dnmt3b的表達,主導干細胞從原始態(tài)到始發(fā)態(tài)的轉變。一方面,Dnmt3b 確保從頭DNA 甲基化模式的建立,并通過(guò)甲基化及時(shí)下調 Sox2 等多能性因子。另一方面,Dnmt3b 通過(guò)互作來(lái)促進(jìn)Smad2/3與上胚層基因上的低甲基化中心結合,從而激活上胚層轉化。其次,當上胚層向中內胚層分化啟動(dòng)時(shí),Dnmt3b 下調,Smad2/3-Smad4形成經(jīng)典的TGFb轉錄復合物,結合并促進(jìn)中內胚層基因的轉錄。
總的來(lái)說(shuō),這項工作首次發(fā)現Dnmt3b是磷酸化的Smad2/3的新型互作因子,與Smad2/3共同決定干細胞命運,并闡明了信號傳導和表觀(guān)遺傳的協(xié)同作用機制,進(jìn)而為理解TGFβ信號在生理學(xué)和病理學(xué)中的作用提供了新的思路。
上海交通大學(xué)醫學(xué)院王瓊研究員,上海市免疫學(xué)研究所杜艷華助理研究員和上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院章永春副教授為該論文通訊作者。上海交通大學(xué)醫學(xué)院趙冰楠碩士,博士研究生于秀偉,施金彤碩士,助研馬雙羽博士和李世召博士為該論文的共同第一作者。上海市免疫學(xué)研究所葉幼瓊研究員為本研究提供了重要支持。
上海交通大學(xué)醫學(xué)院王瓊課題組招聘助理研究員和博士后王瓊課題組(https://www.shsmu.edu.cn/cbms/info/1137/4274.htm)主要使用基因組學(xué)、表觀(guān)遺傳學(xué)和計算生物學(xué)等方法,結合干細胞、類(lèi)器官和動(dòng)物等多種模型研究干細胞在生理或病理情況下的分化調控機制,最終促進(jìn)干細胞的臨床應用。相關(guān)研究成果發(fā)表在Cell Stem Cell、Nature Communications (2篇)、Developmental Cell、Genes & Development等國際權威雜志。課題組誠聘優(yōu)秀人才(包括助理研究員和博士后)加入團隊,共同探索干細胞的分化調控機制,助推干細胞的臨床應用。課題組將為各位成員提供優(yōu)厚福利待遇,一流科研平臺和廣闊發(fā)展前景。詳細情況請參考:https://www.shsmu.edu.cn/rlzy/info/1011/3227.htm
論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-024-54433-5
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