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廣譜抗病毒藥物開(kāi)發(fā)的大背景
肆虐全球的Covid-19大爆發(fā)暴露了人類(lèi)公共衛生事業(yè)的巨大缺陷與漏洞。對于制藥組織來(lái)說(shuō),及時(shí)開(kāi)發(fā)出有針對性的抗病毒藥物成為了這場(chǎng)風(fēng)暴的核心要素。盡管疫苗和抗病毒藥物以完全超越常規標準的速度實(shí)現,但全球仍然成為了病毒肆虐的歡場(chǎng),而帶給人類(lèi)的卻是極其慘痛的損失,大量患者由于得不到及時(shí)有效的救治而失去生命。
盡管風(fēng)暴尚未消退,但制藥界對于這場(chǎng)挑戰帶給人類(lèi)的反思已經(jīng)展開(kāi),其中重要的一項在于廣譜抗病毒藥物(BSA, broad-spectrum antivirals)的開(kāi)發(fā)。
我們知道,市場(chǎng)上有很多廣譜抗生素(broad-spectrum antibiotics)藥物。所謂廣譜抗生素,是同時(shí)作用于革蘭氏陽(yáng)性菌和革蘭氏陰性菌這兩個(gè)主要細菌群的抗生素,[1] 或任何作用于多種致病細菌的抗生素。[2] 當懷疑細菌感染但細菌群未知(也稱(chēng)為經(jīng)驗性治療),或懷疑感染多組細菌時(shí),通??梢允褂眠@些廣譜抗生素藥物穩定病情。特別是對于危及生命的感染,針對性的治療不能等到病原體被確定才開(kāi)展,廣譜抗生素的作用在這種情形下就是無(wú)可替代了。
廣譜抗生素與那些針對特定細菌群有效的窄譜抗生素(narrow-spectrum antibiotic)形成對比。[3] 常用的廣譜抗生素的一個(gè)例子是氨芐西林 (ampicillin,亦稱(chēng)氨芐青霉素,圖1)。Ampicillin是一種β-內酰胺類(lèi)抗生素,可治療多種細菌感染。[4] 適應癥包含呼吸道感染、泌尿道感染、腦膜炎、沙門(mén)氏菌感染癥,以及心內膜炎。
除了ampicillin之外,常見(jiàn)的廣譜抗生素藥物還包括強力霉素、米諾環(huán)素、氨基糖苷類(lèi)(鏈霉素除外)、阿莫西林/克拉維酸 (Augmentin)、阿奇霉素、碳青霉烯類(lèi)(例如亞胺培南)、哌拉西林/他唑巴坦、喹諾酮類(lèi)藥物(例如環(huán)丙沙星)、四環(huán)素類(lèi)藥物(sarecycline除外)、氯霉素、替卡西林、甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲惡唑 (Bactrim)等眾多類(lèi)型。
圖1. Ampicillin化學(xué)結構
相對于廣譜抗生素的遍地開(kāi)花,廣譜抗病毒藥物BSA的開(kāi)發(fā)就明顯滯后。盡管有很多潛在的廣譜抗病毒藥物處在不同的臨床階段,但目前很少有真正的廣譜抗病毒藥物得到有效利用。概念中的廣譜抗病毒藥 (BSA) 是可抑制多種病毒(屬于兩個(gè)或多個(gè)病毒科的病毒)復制的藥物。BSA 通過(guò)抑制病毒蛋白(如聚合酶和蛋白酶),或通過(guò)靶向宿主細胞的因子起效,這些宿主細胞的因子在病毒感染和復制過(guò)程中為病毒所利用。[5]
截至 2021 年,有 150 種已知的 BSA 處于不同的開(kāi)發(fā)階段,可有效對抗 78 種人類(lèi)病毒。[6] BSA 是治療新出現以及重新出現的病毒的潛在候選者,例如埃博拉病毒、馬爾堡病毒和 SARS-CoV-2。[7] 許多 BSA 顯示出對其他病毒的抗病毒活性,而不是最初研究的病毒,例如瑞德西韋(remdesivir)和干擾素 α (interferon alpha)。
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廣譜抗病毒藥物開(kāi)發(fā)的必要性與挑戰
導致缺乏廣譜抗病毒藥物的一個(gè)因素是病毒檢測技術(shù)滯后,尤其是針對呼吸道病毒的檢測。今天開(kāi)發(fā)流感和呼吸道合胞病毒 (RSV,respiratory syncytial virus) 的常規檢測,是因為已知這些感染會(huì )導致全世界數以千計的患者住院,并且可以對他們進(jìn)行治療。但直到最近,用于廣泛檢測其他病毒的測試仍不可用,或未被常規使用。
這種遲滯導致了一種惡性循環(huán):沒(méi)有正確的測試,人們就不知道病毒引起的嚴重疾病的范圍;而出于對病毒致病嚴重程度的不可知,對于病毒診斷和抗病毒藥物的開(kāi)發(fā)動(dòng)力就不能被調動(dòng)起來(lái)。盡管檢測技術(shù)在不斷改進(jìn),但檢測仍未廣泛開(kāi)展。即使進(jìn)行了檢測,許多病毒病原體也無(wú)法獲得治療。這正是 COVID-19 大流行初期發(fā)生的情況:我們對致病病毒知之甚少,也沒(méi)有針對感染的治療方法。
盡管 SARS-CoV-2 是已知的第七種感染人類(lèi)的冠狀病毒,但人類(lèi)在挑戰面前快速應對的表現仍然不夠合格。雖然有效的 COVID-19 管理需要抗病毒和抗炎治療策略,但在危局面前,人們需要一種有效、安全并且快速(這個(gè)快速的標準這里尤為重要)的抗病毒藥物用于治療和預防。
然而,鑒于藥物開(kāi)發(fā)從靶標發(fā)現到批準,平均需要 12 年的時(shí)間,期望在短時(shí)間內開(kāi)發(fā)出安全且具有選擇性的抗病毒藥物是不切實(shí)際的。試想如果存在合理開(kāi)發(fā),效果明顯的廣譜抗病毒藥物,它們就有可能改變全球對 SARS-CoV-2 的反應,并顯著(zhù)減輕大流行對全球人民生命安全和全球經(jīng)濟的影響。
如果從積極的角度來(lái)看到這場(chǎng)COVID-19疫情,它至少促使人們在開(kāi)發(fā)廣譜抗病毒藥物的方面進(jìn)行反思與改進(jìn),這一點(diǎn)可以從兩個(gè)方面看待。[8]
首先,COVID-19疫情提高了人們對于病毒致命性的認識:除流感和 RSV 之外的多種呼吸道病毒,包括冠狀病毒、人偏肺病毒(HMPV)、副流感病毒,甚至普通感冒病毒(鼻病毒),都可能導致嚴重疾病和高度的住院率,甚至嚴重威脅患者生命安全。這刺激了一個(gè)“良性循環(huán)”:我們測試的越多,我們發(fā)現的導致嚴重疾病的病毒就越多,我們就越認識到需要開(kāi)發(fā)新的治療策略來(lái)對抗它們。
其次,最近由甲型禽流感(H3N2,1968 年)、豬流感(H1N1,2009 年)和 COVID-19 冠狀病毒(SARS-CoV-2,2019 年)等新型病毒引起的疫情,凸顯了需要用于大流行防范的廣譜抗病毒藥物。與 SARS 和 MERS 冠狀病毒一樣,這些大流行性病毒是人畜共患的:它們從非人類(lèi)動(dòng)物宿主傳播,有時(shí)通過(guò)中間宿主傳播。
這意味著(zhù)它們對人類(lèi)健康構成嚴重威脅,特別是當病毒(如 SARS-CoV-2)非常適合人際傳播的情況下,因為人類(lèi)宿主對這些新出現的病原體缺乏特異性免疫力。在這種困局面前,開(kāi)發(fā)廣譜抗病毒藥物就是抑制病毒快速失控傳播的關(guān)鍵武器。
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廣譜抗病毒藥物開(kāi)發(fā)思路[9]
大多數批準的抗病毒藥物以病毒蛋白為靶點(diǎn),通常選擇性地針對一種病毒起作用。例如Paxlovid中的抗病毒活性擬肽nirmatrelvir,靶向的就是SARS-CoV-2病毒的3C樣蛋白酶(3C-like protease,或稱(chēng)main protease,簡(jiǎn)寫(xiě)為3CLPro或MPro)。從歷史上看,抗病毒藥物開(kāi)發(fā)更是不成比例地集中在靶向病毒蛋白上,支持了“直接作用抗病毒藥物” (DAAs, direct-acting antivirals)的開(kāi)發(fā)。
然而,除了直接靶向病毒蛋白受體之后,我們也知道,病毒利用大量宿主細胞蛋白(host proteins)來(lái)執行其生命周期中的重要步驟,這些被病毒挾持的宿主細胞蛋白同樣可以作為開(kāi)發(fā)“宿主定向抗病毒藥物 ”(HDAs,host-directed antiviral agents)的目標。由于來(lái)自一個(gè)家族的病毒通常使用相同的宿主細胞蛋白,因此靶向這些蛋白可能產(chǎn)生具有廣譜抗病毒活性的藥物,并對病毒耐藥性制造了障礙。HDA 的一個(gè)關(guān)鍵特征是它們的開(kāi)發(fā)可以在病毒病原體爆發(fā)之前進(jìn)行。近年來(lái),有十幾種人畜共患病毒引起了致命的人類(lèi)疾病,并且仍可能將是未來(lái)爆發(fā)的潛在來(lái)源,這一事實(shí)凸顯了對 HDA 的需求。
1.阻止病毒入侵的宿主蛋白酶抑制劑
流感病毒、副流感病毒和冠狀病毒等呼吸道病毒,依賴(lài)宿主蛋白酶來(lái)激活它們的進(jìn)入因子(entry factor),從而促進(jìn)膜融合和進(jìn)入氣道上皮細胞??缒さ鞍酌附z氨酸 2 (TMPRSS2, transmembrane protease serine 2)是一種普遍表達的絲氨酸蛋白酶,對人流感病毒的血凝素(HA, hemagglutinin)和 SARS 樣冠狀病毒的刺突 S 蛋白的切割和激活至關(guān)重要。[10]
TMPRSS2 對于宿主發(fā)育和體內平衡是可有可無(wú)的,因此可能構成一個(gè)有吸引力的治療靶點(diǎn)。[11] 需要注意的是,那些被HDA靶向的宿主蛋白,應該是那些對宿主細胞本身不構成關(guān)鍵作用的蛋白,因此它們的抑制不會(huì )產(chǎn)生不良影響或者安全問(wèn)題,這一點(diǎn)是開(kāi)發(fā)HAD的前提條件。
圖2. Camostat化學(xué)結構
卡莫司他(Camostat,圖2)是一種臨床階段的絲氨酸蛋白酶抑制劑,能夠阻斷 SARS-CoV-2 和流感病毒的病毒進(jìn)入。[9] 與呼吸道病毒的發(fā)病機制有關(guān)的絲氨酸蛋白酶被歸類(lèi)為胰蛋白酶樣蛋白酶(trypsin-like proteases),具有結構上保守的活性位點(diǎn)。胰蛋白酶樣蛋白酶的這一特性可用于設計具有廣譜活性的抑制劑。[12] 盡管卡莫司他抑制了 SARS-CoV-2 的進(jìn)入和復制,但它并沒(méi)有完全消除病毒復制,這可能反映了S 蛋白激活的方式有可能不是通過(guò)單一途徑實(shí)現的。
除了TMPRSS2之外,宿主細胞的弗林蛋白酶(furin)也在病毒侵入宿主的過(guò)程中起到關(guān)鍵的切割作用,因此也可以提供開(kāi)發(fā)HDAs的思路。弗林蛋白酶介導的切割可以作用于不同病毒家族的幾種病毒糖蛋白,包括 Borna-、Bunya-、Corona-、Filo-、Flavi-、Herpes-、Orthomyxo-、Paramyxo-、Pneumo-、Retro - 和 Toga 病毒。[13]
2.誘導干擾素抗病毒[8]
HDAs的開(kāi)發(fā)也可以通過(guò)增強患者自身對病毒感染的免疫反應來(lái)實(shí)現。這種策略不僅可以避免病毒耐藥性,而且為開(kāi)發(fā)廣譜抗病毒藥物提供了可能。這是因為它們觸發(fā)了人體對任何病毒的自然防御,而無(wú)論病毒的身份、突變狀態(tài)或耐藥性如何。因此,這種針對宿主的抗病毒藥物作為廣譜抗病毒藥物具有最大的前景。
干擾素(IFN,Interferons)是一類(lèi)信號蛋白,由各種細胞類(lèi)型分泌,協(xié)調人體的天然抗病毒反應。干擾素家族中的I 型干擾素,作為先天免疫反應的一部分組成人體抵御病毒的第一道防線(xiàn),它包括多種 IFNα和 IFNβ亞型,以及四種 III 型 IFNλ 亞型。先天免疫(innate immunity)是人體對感染的一種本能反應,對感染病原體而言是自發(fā)的和非特異性的。
在受感染細胞內,IFNβ 和 IFNα 亞型啟動(dòng)即時(shí)強烈的反應,來(lái)協(xié)調抗病毒反應;與此同時(shí),它們也啟動(dòng)未感染細胞,以阻止病毒復制的途徑,產(chǎn)生針對病毒的抗體和T細胞的適應性免疫反應,并激活免疫調節途徑。由于 I 型干擾素受體在全身廣泛表達,因此它們可以保護許多不同類(lèi)型的細胞免受病毒侵害。IFNβ 對大多數呼吸道病毒的反應比 IFNα 更強。IFNλ 的作用類(lèi)似,但其受體主要在上皮細胞上表達,因此限制了它對其它細胞的保護作用。
IFNβ 和 IFNα 的注射劑已獲得 FDA 批準,用于治療復發(fā)緩解型多發(fā)性硬化癥 (MS,multiple sclerosis) 和人乳頭瘤病毒(HPV,human papillomavirus)、乙型肝炎病毒 (HBV,hepatitis B virus) 和丙型肝炎病毒 (HCV,hepatitis C virus)感染。由于IFNβ對呼吸道病毒的效力和對多種細胞類(lèi)型的影響,IFNβ 作為治療劑可能比 IFNα 和 IFNλ 具有更大的開(kāi)發(fā)潛力。
3.細胞內核苷酸耗盡以阻止病毒復制的策略
病毒復制增加了可用核苷酸的細胞負擔,這個(gè)思路可以作為干擾病毒復制的機理。肌苷 5'-單磷酸脫氫酶(IMPDH)催化鳥(niǎo)嘌呤核苷酸(guanine nucleotides)生物合成中的一個(gè)重要步驟,即將 IMP(肌苷酸,Inosine monophosphate)轉化為黃苷單磷酸 (XMP,xanthosine monophosphate)。XMP 介導單磷酸鳥(niǎo)苷 (GMP,guanosine monophosphate)的形成,這是許多細胞過(guò)程的關(guān)鍵分子。抑制 IMPDH 會(huì )導致細胞內鳥(niǎo)嘌呤核苷酸水平耗盡,從而限制病毒復制所需的 RNA 和 DNA 合成。
圖3. IMPDH抑制劑阻斷單磷酸鳥(niǎo)苷GMP合成的過(guò)程
IMPDH 抑制劑的例子有VX-497(圖4),它一種具有廣譜活性的非競爭性 IMPDH 抑制劑;[14] 還有利巴韋林(ribavirin,圖4),它是一種競爭性 IMPDH 抑制劑(所謂競爭性或非競爭性,指的是抑制劑是否與天然底物競爭性地結合受體的活性位點(diǎn)。如果是,那就屬于競爭性抑制劑;如果抑制劑通過(guò)結合其它位點(diǎn)抑制底物,那就屬于非競爭性抑制劑)。
圖4. IMPDH抑制劑VX-497和Ribavirin化學(xué)結構
— 總結 —
在超過(guò)90種獲批的抗病毒藥物中,HIV 和 HCV 藥物占所有獲批藥物的三分之二 。[15] 抗病毒藥物以小分子為主,占批準的抗病毒藥物的 87%。盡管對宿主靶標及其在抗病毒生命周期中的相關(guān)性進(jìn)行了廣泛研究,但針對宿主蛋白的獲批抗病毒藥物(HDAs)的數量仍顯著(zhù)滯后。所有批準的抗病毒藥物中只有約 10% 是針對宿主蛋白的,其中一半是干擾素相關(guān)的生物制劑。[16]
抗病毒藥物的臨床開(kāi)發(fā)和應用,需要仔細考慮其假定的益處及其潛在的副作用。當靶向宿主蛋白時(shí),藥物相關(guān)不良事件(DAE,drug-related adverse events) 和毒性的話(huà)題幾乎是不可避免的。DAE 的來(lái)源包括化學(xué)相關(guān)毒性或途徑相關(guān)毒性。潛在藥物的化學(xué)毒性主要是不穩定官能團導致的。
另一方面,途徑相關(guān)毒性則是與藥物的生物活性相關(guān)的。直接作用抗病毒藥物(DAAs) 的一個(gè)優(yōu)勢在于它們攻擊的是病毒蛋白而不是宿主蛋白,從而減少理論上對脫靶效應的擔憂(yōu)。然而,即使使用 DAA,脫靶效應也是不可避免的,因為已知的宿主蛋白有數萬(wàn)種。
對于宿主定向抗病毒藥物 HDA,安全性問(wèn)題是一個(gè)核心考慮的內容,因為應避免靶向對細胞發(fā)育和體內平衡很重要的蛋白質(zhì)或途徑。HCQ (羥氯喹, hydroxychloroquine) 在治療 COVID-19 過(guò)程中暴露出來(lái)的心臟毒性就有效地說(shuō)明了這一點(diǎn)。[17] 在 HDA 的開(kāi)發(fā)中,途徑相關(guān)毒性需要在藥物開(kāi)發(fā)的臨床前和轉化階段進(jìn)行更嚴格的研究。
呼吸道病毒感染,例如由流感和冠狀病毒引起的感染,或由具有大流行潛力的登革熱或寨卡病毒引發(fā)的出血熱,都是可以在幾周內消退的急性感染。因此,治療策略的特點(diǎn)是短期使用,允許更高的閾值來(lái)接受非致命的副作用。值得注意的是,FDA和數據安全監測委員會(huì )在批準抗SARS-CoV-2藥物中奉行了這樣的風(fēng)險管理。
SARS-CoV-2 大流行凸顯了抗病毒藥物庫中對 DAA 和 HDA 的需求,同時(shí)也暴露了我們在廣譜抗病毒藥物開(kāi)發(fā)領(lǐng)域的缺陷。以史為鑒,廣譜抗病毒藥物的研發(fā)不可再次延誤。
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