在一項新的研究中，來(lái)自美國斯克里普斯研究所等研究機構的研究人員他們研究了在COVID-19大流行的不同階段，不同的強制措施---包括呆在家中、保持社交距離和旅行限制---在防止本地和區域傳播方面的功效，并指出哪些公共衛生措施有效地緩解了COVID-19的傳播，哪些無(wú)效。相關(guān)研究結果于2023年12月14日在線(xiàn)發(fā)表在Cell期刊上，論文標題為“Genomic surveillance reveals dynamic shifts in the connectivity of COVID-19 epidemics”。
這些作者發(fā)現，本地傳播是由地點(diǎn)之間的旅行量驅動(dòng)的，而不是由地點(diǎn)之間的地理距離驅動(dòng)的。他們還發(fā)現，部分關(guān)閉美墨邊境并不能有效防止這種病毒的跨境傳播。這些發(fā)現與正在進(jìn)行的基因組監測相結合，有助于指導公共衛生政策，預防未來(lái)的流行病，緩解 COVID-19 的新“流行”階段。
論文共同通訊作者、斯克里普斯研究所Kristian Andersen實(shí)驗室的項目科學(xué)家兼基因組流行病學(xué)家Mark Zeller博士說(shuō)，“我們的研究表明，這并不一定是地理位置有多接近；真正的衡量標準是兩個(gè)地點(diǎn)在人員流動(dòng)方面有多大的聯(lián)系。一般來(lái)說(shuō)，SARS-CoV-2可能是呼吸道病毒傳播的良好模式，了解這些病毒的傳播方式有助于我們?yōu)槲磥?lái)的大流行病制定有針對性的措施。”
圣地亞哥縣流行病學(xué)和免疫服務(wù)處醫療主任 Seema Shah 醫學(xué)博士說(shuō)，“這些寶貴的信息有助于指導減輕未來(lái)病毒威脅傳播的策略，包括我們正在進(jìn)行的基因組監測方法，如廢水檢測。在全球挑戰需要聯(lián)合應對的時(shí)代，這項新研究也證明了學(xué)術(shù)研究機構與邊境兩側的公共衛生實(shí)驗室和醫院之間的緊密合作。”
為了解釋旅行模式的變化如何影響 COVID-19 在大流行頭兩年的傳播，這些作者定量確定了在不同地點(diǎn)和時(shí)間點(diǎn)收集到的病毒序列之間的遺傳相似性。Zeller說(shuō)，“兩個(gè)不同地點(diǎn)的病毒基因組越相似，這些地點(diǎn)在人員流動(dòng)方面的聯(lián)系就越緊密。”
這些作者對來(lái)自美國加州圣地亞哥市和墨西哥下加利福尼亞州的 82000 多份 SARS-CoV-2 樣本進(jìn)行了測序，并將這些序列與來(lái)自北美和世界其他地區的 SARS-CoV-2 基因組進(jìn)行了比較。然后，他們將這些基因組數據與空中和陸地旅行數據（基于匿名手機追蹤）數據庫進(jìn)行整合，以估算北美不同縣之間的連通性。
在大流行病的早期階段，針對COVID-19 的規定包括嚴格的居家和社交距離措施，因此傳播主要發(fā)生在本地和區域層面---鄰縣內部和鄰縣之間。但隨著(zhù)這些規定的放寬，人們開(kāi)始更自由地旅行，可以預見(jiàn)的是，來(lái)自遠方的傳播增加了。
圖片來(lái)自Cell, 2023, doi:10.1016/j.cell.2023.11.024。
論文第一作者Nathaniel Matteson博士說(shuō)，“在整個(gè)大流行的頭兩年里，鄰縣之間的流動(dòng)性幾乎保持不變，但正是這些從圣地亞哥到更遙遠的縣或鄰近州的長(cháng)途流動(dòng)真正打亂了這些早期的規定。在規定放寬后，圣地亞哥流行的病毒中約有 50%是當地流行的病毒，還有 50%是最近通過(guò)不同地點(diǎn)之間的旅行傳播進(jìn)來(lái)的。”
他們的分析還顯示，在整個(gè)大流行期間，圣地亞哥和附近的下加利福尼亞州之間一直存在病毒傳播，這表明部分關(guān)閉美墨邊境并不能有效防止病毒傳播。
Matteson說(shuō)，“這一發(fā)現為越來(lái)越多的證據增添了新的內容，這些試圖阻止來(lái)自某一特定地點(diǎn)的人流的有針對性的措施效果很差，而保持社交距離在減少傳播方面則有效得多。這也凸顯了區域和國際合作以及資源共享對于有效監測和預防疾病的重要性。”
接下來(lái)，這些作者計劃以更精細的尺度研究傳播動(dòng)態(tài)。Zeller說(shuō)，“如今，我們正在研究圣地亞哥縣內的超本地傳播---例如，傳播如何受到通勤模式等因素的影響。”
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