前言
長(cháng)久以來(lái),親電性基團是藥物開(kāi)發(fā)中的雷區,因而在以往經(jīng)典的藥物化學(xué)教材中,總會(huì )建議避免在藥物分子結構中引入此類(lèi)官能團,如環(huán)氧、吖啶、Michael受體等,因為其具有的高反應性,可能會(huì )與多種生物大分子相互作用,引起嚴重的毒副作用。
早前的阿司匹林、蘭索拉唑、氯吡格雷等在近年來(lái)的研究中發(fā)現,均以共價(jià)鍵形式與靶點(diǎn)作用。受此啟發(fā),共價(jià)型藥物的開(kāi)發(fā)慢慢進(jìn)入人們的視野,在抗癌、抗病毒、糖尿病等多個(gè)領(lǐng)域內顯現出了非共價(jià)結合藥物難以匹及的優(yōu)勢,如療效更為持久、治療劑量更低等、不易產(chǎn)生耐藥性等。
由于共價(jià)結合和非共價(jià)結合的作用機制不同,因而在研發(fā)過(guò)程采用傳統的評價(jià)指標,如解離常數、IC50、EC50等,難以真正體現其效能與安全性,這主要是因為藥物分子與靶點(diǎn)形成共價(jià)鍵受反應速率的影響,而非共價(jià)結合作用則僅是一個(gè)熱力學(xué)平衡過(guò)程,在短時(shí)間內就能顯現出化合物的活性,采用傳統的評價(jià)指標往往會(huì )造成誤判。
共價(jià)結合藥物和天然產(chǎn)物
從天然產(chǎn)物中發(fā)現新的藥物是新藥開(kāi)發(fā)項目中常見(jiàn)的策略,而且有很多藥物都是基于這一方式發(fā)現的,如紫杉醇、喜樹(shù)堿、嗎 啡等,另外一種方式則是對天然產(chǎn)物進(jìn)行結構修飾,得到效果更佳的化合物,如從水楊酸到阿司匹林,從嗎 啡到美沙 酮,據統計,臨床上約占60%的藥物都是基于上述策略得到的。
雖然共價(jià)結合藥物是近幾年才熱門(mén)起來(lái),在自然界中,這一概念卻并不罕見(jiàn),青霉素、焦土霉素、磷霉素等一些抗生素都是以共價(jià)鍵的形式與細菌中的目標靶點(diǎn)相互作用。利普斯他汀是一種從鏈霉菌中分離出來(lái)的胰脂酶不可逆抑制劑,基于此天然產(chǎn)物,Roche開(kāi)發(fā)出新型減肥藥奧利司他,諸如此類(lèi)的例子還有很多。
以上諸多天然產(chǎn)物的實(shí)例證明,共價(jià)結合作用是藥物設計中被忽視的寶地!藥物靶點(diǎn)大多數都是蛋白質(zhì),其中絲氨酸、賴(lài)氨酸、半胱氨酸、組氨酸等殘基中含有親核活性官能團(羥基、巰基、氨基等),因而,蛋白質(zhì)可以作為一個(gè)優(yōu)良的親核體,可以與具有親電活性的基團發(fā)生作用,形成共價(jià)鍵。對于此類(lèi)化合物的設計,最大的難點(diǎn)在于選擇性,否則容易引起嚴重的副反應,造成開(kāi)發(fā)失敗。
目前,約30%以酶為靶點(diǎn)的藥物采用共價(jià)結合形式,主要是因為這一設計理念是近幾年才被接受,在此之前,活性反應基團是藥物設計中盡可能避免的結構。特拉匹韋由Merck開(kāi)發(fā),在2011年獲得FDA上市許可,通過(guò)與HCV蛋白酶中具有催化作用的絲氨酸殘基(羥基)形成半縮醛,抑制其活性,從而實(shí)現抗病毒作用。最初該化合物在標準的IC50測試中,活性很差,幾近放棄,然而在特別設計的活性測試中,則表現優(yōu)異,特拉匹韋的研發(fā)歷程深刻體現了在共價(jià)結合藥物的研發(fā)中,需要一套與傳統非共價(jià)結合藥物開(kāi)發(fā)不同的評價(jià)方法。
另外一個(gè)比較經(jīng)典的例子是EGFR受體不可逆抑制劑阿法替尼的開(kāi)發(fā)(2013年上市),其結構中的親電活性基團丙烯酰胺與EGFR受體活性位點(diǎn)中的半胱氨酸殘基(巰基)形成共價(jià)鍵,克服了第一代EGFR(吉非替尼、厄洛替尼等)受體抑制劑出現的耐藥性問(wèn)題,同時(shí)對非耐藥性EGFR受體也表現出良好的活性。以上兩個(gè)成功的例子證明了共價(jià)結合藥物具有的潛力,另一方面,其研發(fā)過(guò)程也為共價(jià)結合藥物的發(fā)展提供了寶貴的經(jīng)驗!
藥物—靶點(diǎn)結合歷程
與非共價(jià)結合藥物相同的是,共價(jià)結合藥物首先與靶點(diǎn)相互作用,形成藥物-靶點(diǎn)結合物,由于此歷程屬于熱力學(xué)過(guò)程,因而能夠很快的達到平衡,其親和力可以用解離常數Ki或者IC50等參數進(jìn)行描述。不同之處在于,第二步共價(jià)鍵的形成,與第一步相比,共價(jià)鍵的形成速率相對較慢,且存在一個(gè)反應平衡常數Ki*,因而,共價(jià)結合物藥物的總體結合情況需要考慮兩個(gè)參數:Ki以及Ki*。當krea遠遠大于krev-rea時(shí),反應平衡常數趨向無(wú)窮大,可視為不可逆共價(jià)結合,當krea與krev-rea相差并不是很大,即Ki*在一個(gè)合理的數值范圍內,可視為可逆共價(jià)結合。
結合機理
藥物靶點(diǎn)大多數都是蛋白質(zhì),由于其結構中富含羥基、巰基、氨基等官能團,因而本質(zhì)上可以作為親核試劑,共價(jià)結合化合物通常在結構中含有親電性官能團,如Michael受體,環(huán)氧、鹵素、羰基、異氰等結構,可作為親電體,兩者相互反應形成新的共價(jià)鍵,其涉及到的反應類(lèi)型主要有以下幾種:?;磻?、烷基化反應、Michael加成、二硫鍵化、Pinner反應等,采用哪種共價(jià)鍵形成方式,取決于靶點(diǎn)結合位點(diǎn)的性質(zhì),總的來(lái)說(shuō),可以選擇的余地較大。
2014年,美國十大暢銷(xiāo)藥中,其中之一為埃索美拉唑(消旋體為奧美拉唑)。奧美拉唑在1970年代被開(kāi)發(fā)出來(lái),經(jīng)過(guò)若干優(yōu)化和臨床研究后,于1988年上市,兩年后才發(fā)現其質(zhì)子泵抑制作用是基于共價(jià)鍵形式的,奧美拉唑在靶點(diǎn)附近經(jīng)在酸性條件下活化,形成活性亞磺酰胺衍生物活性產(chǎn)物,然后與靶點(diǎn)中的半胱氨酸殘基(巰基)形成共價(jià)鍵,抑制胃酸的分泌。
另一個(gè)暢銷(xiāo)共價(jià)藥便是氯吡格雷,它需要在肝 臟內經(jīng)P450氧化酶活化,生成含硫化合物,然后與P2Y12受體中的半胱氨酸殘基形成二硫鍵,抑制血小板凝聚。上述兩個(gè)藥物目前應用非常廣泛,而且在最初設計的時(shí)候并不是以共價(jià)鍵作用形式,只是在后來(lái)的機理研究中發(fā)現,是以共價(jià)鍵作用與靶點(diǎn)結合,產(chǎn)生不可逆的抑制作用。
含有氰基的化合物,通常在與蛋白中的親核性官能團如羥基、巰基發(fā)生Pinner反應,形成亞胺酯鍵,通常該類(lèi)共價(jià)鍵是可逆的,比較成功的例子如DPP4抑制劑沙格列汀和維格列汀等,用于II型糖尿病的治療。除此之外還有奧當卡替,用于絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松癥的治療,但由于其潛在的中風(fēng)風(fēng)險,2016年Merck宣布放棄該化合物。
至于其他的幾種共價(jià)結合機理,如烷基化、?;?、Michael加成等,在此不一一列舉,其本質(zhì)都是生物大分子中的親核性基團與藥物分子中的親電基團進(jìn)行相互作用。
選擇性的控制
共價(jià)結合藥物的選擇性至關(guān)重要!在選擇性的問(wèn)題上,目前比較常見(jiàn)的策略是,首先設計對目標靶點(diǎn)具有高度選擇性非共價(jià)結合作用先導物,然后在此化合物的基礎上,進(jìn)行活性反應官能團的優(yōu)化設計,即先找到合適的“彈殼”,然后再加裝合適的“彈頭”。
比較典型的例子如奧西替尼的開(kāi)發(fā),最初得到的先導化合物1在體外靶點(diǎn)結合實(shí)驗表現出了優(yōu)異的結合性,但是在細胞實(shí)驗中其親和性驟降了近70倍之多,可能是因為細胞中高濃度ATP與其競爭性的靶點(diǎn)結合所導致的,因而采用不可逆的共價(jià)結合作用策略,成功開(kāi)發(fā)出第三代肺癌靶向藥奧西替尼,該藥于2017年獲得FDA和歐盟的上市許可,同年獲得CFDA的上市許可。
除上述提及的策略外,還可以通過(guò)人體不同組織的理化特性實(shí)現選擇性,如奧美拉唑,由于其需要在強酸性條件下才能活化,因而可以選擇性的作用于質(zhì)子泵。
另外,通過(guò)精心設計的親電性基團也能實(shí)現選擇性。α-氰基取代丙烯酰胺與巰基的Michael加成為可逆過(guò)程,在特定的靶點(diǎn)中,由于其他氨基酸殘基的非共價(jià)作用,可以穩定該加成產(chǎn)物,而其他非目標靶點(diǎn)不能實(shí)現該效應,從而實(shí)現選擇性,當然該策略需要有非常強的生物信息學(xué)支撐,否則難以實(shí)現。
**問(wèn)題
雖然共價(jià)結合藥物設計策略目前日趨成熟,但其風(fēng)險仍然不容小覷,尤其是不可逆的共價(jià)結合作用。由于小分子化合物與靶點(diǎn)形成新的共價(jià)鍵,因而會(huì )導致蛋白結構的變化,存在免疫反應的可能性,但此類(lèi)報道較為罕見(jiàn)。脫靶效應也是引起**的重要原因,針對此問(wèn)題,提高化合物的選擇性以及較低的治療劑量是行之有效的解決方案。
小結
目前大多數的共價(jià)結合藥物集中在抗癌領(lǐng)域,但是隨著(zhù)技術(shù)和理論的日趨成熟,此類(lèi)藥物將在越來(lái)越多的疾病領(lǐng)域大顯身手。
參考資料
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