生物體中頭部和腹部不同器官的細胞都包含相同的基因組,但不同類(lèi)型細胞在分化后只表達一部分基因子集,可稱(chēng)為細胞特異性表達。
近日,來(lái)自紐約大學(xué)(NYU)生物學(xué)系的Stephen Small教授所帶領(lǐng)的研究團隊探索了胚胎形成過(guò)程中細胞特異性表達的基因其啟動(dòng)子的激活機制,為細胞是如何分化而變得彼此不同給出了一些答案,相關(guān)結果發(fā)表在《Molecular Cell》上。
細胞特異性基因表達
科學(xué)家們早就認識到了生命體遵循“Crick 中心法則”。這一法則所描述的遺傳信息傳遞的過(guò)程為:從DNA轉錄成為RNA, 再從RNA翻譯為蛋白質(zhì)執行生物學(xué)功能;這也是基因表達的過(guò)程??茖W(xué)家們此前已經(jīng)識別了基因表達由啟動(dòng)子作為“開(kāi)/關(guān)”,就像水龍頭一樣,但這些啟動(dòng)子到底是如何被激活的卻不得而知。
此次,研究人員將目光聚焦在了一個(gè)果蠅胚胎發(fā)育過(guò)程中稱(chēng)為“駝背基因”的hunchback (hb)基因上。hb基因能使果蠅胚胎頭部的細胞發(fā)育成為與腹部不同的細胞,也可以理解為hb基因在果蠅頭部細胞中特異性表達, 對頭部細胞的分化起著(zhù)重要的作用。
雙啟動(dòng)子“開(kāi)關(guān)”
研究人員通過(guò)實(shí)驗獲得了hb啟動(dòng)子上的DNA序列,但卻進(jìn)一步發(fā)現hb基因實(shí)際上有兩個(gè)啟動(dòng)子P1和P2。其中P1 是活性啟動(dòng)子,具有兩個(gè)關(guān)鍵功能域—— Zelda 結合域和TATA序列,決定了啟動(dòng)子的活性;P1的激活經(jīng)發(fā)現是由一種叫做Bicoid轉錄因子的蛋白操控的,其具體的操控機制為:Bicoid與另一種與P1相距甚遠的DNA序列(稱(chēng)為增強子)相結合。
一旦這種結合形成,Bicoid就隨后再結合到P1上并使其激活,讓bh基因得以表達。因此,像眾多基因的表達途徑一樣,如果P1被關(guān)閉,hb基因就會(huì )沉默并停止表達;當P1被Bicoid激活,hb基因的轉錄就會(huì )開(kāi)啟,從而進(jìn)行表達。
然而,P2則是一個(gè)非活性啟動(dòng)子,并不具有Zelda和TATA兩個(gè)功能域 ,因此不能像P1一樣對Bicoid產(chǎn)生反應。
為了進(jìn)一步驗證啟動(dòng)子的功能域,研究人員通過(guò)基因編輯敲除了P1上的Zelda和TATA序列,并發(fā)現該啟動(dòng)子隨后失活。而當把這兩個(gè)序列插入P2后,該啟動(dòng)子產(chǎn)生了像P1一樣的功能活性。
“復雜的機體中包含有多種類(lèi)型的細胞,每一種細胞類(lèi)型都是獨特的,因為它能夠開(kāi)啟一類(lèi)細胞特異性基因的表達,” Small教授評價(jià)說(shuō),“我們的研究結果揭示了在早期胚胎發(fā)育中,一個(gè)細胞特異性基因的表達是如何被開(kāi)啟的。”
結語(yǔ)
科學(xué)家們一直知道改變特定基因的開(kāi)啟有可能會(huì )導致出生缺陷或像癌癥這樣的嚴重疾病,但他們對驅動(dòng)這種改變背后所蘊藏的復雜分子學(xué)機制尚不完全清楚。本項研究為生命活動(dòng)的遺傳基礎提供了新的見(jiàn)解,并有助于更好地了解疾病的發(fā)生和出生缺陷。
參考資料:
[1] Biologists discover the intricacies of "on/off switch" that creates cell differentiation
[2] Bicoid-DependentActivation of the Target Gene hunchback Requires a Two-Motif Sequence Code in aSpecific Basal Promoter
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