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CPHI制藥在線(xiàn) 資訊 Nature子刊:高通量策略快速破譯天然抗生素“密碼”,或可對付“超級細菌”

Nature子刊:高通量策略快速破譯天然抗生素“密碼”,或可對付“超級細菌”

熱門(mén)推薦: lysocin 耐藥性感染 抗生素
來(lái)源:生物探索
  2019-07-23
為了對抗抗生素耐藥性感染, 日本東京大學(xué)的研究人員開(kāi)發(fā)了一項高通量策略,為人工合成新候選藥物的抗感染潛力提供了快速測試。

       原以為抗生素的研制能夠抵制細菌感染的威脅, 為病患帶來(lái)更多生機。不幸地是,細菌對環(huán)境的適應能力超乎想象,多耐藥性細菌的出現又為全球公眾健康帶來(lái)新一輪“恐慌”。于是,科學(xué)家又踏上了新一輪的“征服”之路。

       近日, 由日本東京大學(xué)藥學(xué)研究科的研究人員們開(kāi)發(fā)了一項高通量策略來(lái)快速開(kāi)發(fā)lysocin E強效類(lèi)似物,為制造多耐藥性細菌抗生素的快速出爐提供助力。其相關(guān)研究已發(fā)表在《Nature communication》雜志上。

       第一突破:lysocin E的發(fā)現

       Hiroaki Itoh教授在實(shí)驗室 圖片來(lái)源:東京大學(xué)

       2011年,來(lái)自日本東京大學(xué)藥學(xué)研究科的助理教授Hiroshi Hamamoto及其團隊開(kāi)始了尋找多耐藥性細菌抗生素的征途。 2014年,他們收獲了好消息。

       他們在日本西南部沖繩島的亞熱帶島嶼上所采集的土壤樣品中發(fā)現了一種天然抗生素——lysocin E。它是一種由溶桿菌屬細菌產(chǎn)生的天然抗生素,能與細菌膜中的甲萘醌(MK)相互作用,殺滅常見(jiàn)抗生素無(wú)法對付的超級細菌MRSA(耐甲氧西林金黃色葡萄球菌)。其相關(guān)內容已發(fā)表在《Nature chemical biology》雜志上。

       盡管這一天然抗生素表現出強大的抗菌活性,但在人體試驗中并不能成為的治療藥劑。因此,Hiroshi Hamamoto教授及其團隊又開(kāi)始了思考如何研究其化學(xué)結構與活性的關(guān)系(SAR),來(lái)開(kāi)發(fā)最有效的人工合成化合物。

       第二突破:全合成破譯復雜化學(xué)結構

       帶著(zhù)這一思考,研究人員們發(fā)現,Lysocin E是一種結構復雜的37元肽,由12個(gè)氨基酸殘基組成,具有N-甲基化酰胺和酯鍵,看起來(lái)有點(diǎn)像個(gè)“美麗的手環(huán)”。

       也正是因為其結構復雜到難以進(jìn)行大量分離或化學(xué)修飾, 所以分步合成其多種類(lèi)似物是非常耗時(shí)且不切實(shí)際的。并且,研究人員還發(fā)現并不是每一條側鏈都與有效殺菌活性相關(guān)。因此,如何破譯這一復雜化學(xué)結構中與有效殺菌活性相關(guān)的生物線(xiàn)索成為了新難題。

       在多次探索之后,研究人員們發(fā)現一種“全合成”的方法能夠破譯這種獨特抗生素中的生物線(xiàn)索。2015年,研究人員們實(shí)現了第一個(gè)相對完整的固相全合成,隨后利用全合成策略的優(yōu)勢,又制備出了15個(gè)具有不同側鏈結構的類(lèi)似物。對這些類(lèi)似物的剖析,讓研究人員們進(jìn)一步發(fā)現了有效抗生物活性的關(guān)鍵側鏈結構特征。

       之后,研究人員們又從其中挑選出四個(gè)側鏈進(jìn)行初步嘗試。同時(shí),也選出七種不同的氨基酸來(lái)測試lysocin E的抗菌活性增強效果。令人驚訝的是,對這四種側鏈和七種氨基酸的所有可能性進(jìn)行組合共建出2,401種不同合成形式的lysocin E修飾。如何構建和篩選這2401種合成物又讓研究人員們犯難了,研究再次陷入僵局。

       終極突破:高通量平臺的快速檢測

       在經(jīng)歷了兩年的探索后,研究人員們終于開(kāi)發(fā)出了一種被稱(chēng)為“單珠—化合物庫策略“(或分裂混合合成策略)的高通量平臺,用來(lái)構建2401種 lysocin E類(lèi)似物并進(jìn)行大規模的SAR(結構-活性)研究。自此研究向前的車(chē)輪又轉動(dòng)起來(lái)了。

       研究人員首先對這2401種類(lèi)似物全部進(jìn)行構建,接著(zhù),通過(guò)串聯(lián)質(zhì)譜測序和兩種微量活性測定來(lái)初步篩選出有效的23種候選化合物。之后,他們又從中挑選出22個(gè)候選物來(lái)對六種常見(jiàn)細菌的殺傷效果進(jìn)行測定。最終研究結果顯示,其中有11種候選物與原始lysocin E抗生素有相當或更好的抗菌活性。

       自此,這一漫長(cháng)的“科學(xué)探究之旅”即將劃上圓滿(mǎn)的句號。Hiroaki Itoh教授及其團隊表示,“我們的方法可用于尋找基于潛在小蛋白質(zhì)天然產(chǎn)物的其他候選藥物,包括用于抗癌或抗病毒。我們也相信,這一快速有效的合成方法可以為早期藥物發(fā)現提速,并有助于限度地發(fā)揮天然復雜分子的在人工新藥制成上的潛力。“

       結語(yǔ)

       目前,研究人員還在繼續對已發(fā)現的三種最有效的lysocin E類(lèi)似物進(jìn)行探究,試圖了解使用極少量的藥劑實(shí)現最有效的細菌殺滅的新型藥物詳細作用機制,并在非人類(lèi)動(dòng)物模型中試驗其治療感染的有效性。

       

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