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CPHI制藥在線(xiàn) 資訊 中科院學(xué)者Nature子刊揭示anti-CRISPR沉默CRISPR-Cas9系統的分子機理

中科院學(xué)者Nature子刊揭示anti-CRISPR沉默CRISPR-Cas9系統的分子機理

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來(lái)源:生物通
  2019-07-09
CRISPR/Cas系統是廣泛存在于細菌和古菌中的抵抗病毒和外源質(zhì)粒入侵的獲得性免疫防御系統。CRISPR-Cas系統分為兩大類(lèi)。

       CRISPR/Cas系統是廣泛存在于細菌和古菌中的抵抗病毒和外源質(zhì)粒入侵的獲得性免疫防御系統。CRISPR-Cas系統分為兩大類(lèi)。

       第一大類(lèi)CRISPR-Cas系統由多亞基組成的效應復合物(如Cascade,Csm complex等)發(fā)揮功能;第二大類(lèi)是由單個(gè)效應蛋白(如Cas9, Cas12,Cas13等)來(lái)發(fā)揮功能。Cas9具有RNA介導的DNA內切酶和RNA內切酶活性。由于可以特異性識別、結合、切割DNA,且具有可編程性,Cas9被廣泛運用于基因編輯和基因表達調控領(lǐng)域。

       2017年,Karen Maxwell課題組報道了3個(gè)來(lái)自于致病菌Neisseria meningitides 的anti-CRISPR蛋白,并命名為AcrIIC1,AcrIIC2,AcrIIC3。這是首次發(fā)現的可以抑制CRISPR-Cas9系統的anti-CRISPR蛋白。結構和功能研究表明,AcrIIC1通過(guò)和Cas9的HNH 結構域催化中心結合,抑制Cas9的基因編輯活性。

       中國科學(xué)院生物物理研究所王艷麗課題組和加拿大多倫多大學(xué)Karen Maxwell課題組的合作論文“Inhibition of CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complex assembly by anti-CRISPR AcrIIC2” 在《自然-通訊》(Nature Communications)雜志在線(xiàn)發(fā)表。

       這項工作報道了2.45埃的apo AcrIIC2和2.28埃的結合了Neisseria meningitides Cas9 (Nme1Cas9) BH domain的AcrIIC2復合物晶體結構,結合體內和體外實(shí)驗,系統闡述了anti-CRISPR蛋白AcrIIC2沉默CRISPR-Cas9系統的分子機理。王艷麗課題組一直致力于CRISPR-Cas系統抗病毒作用機理的研究,前期研究揭示了一系列重要的CRISPR-Cas系統的作用機理(Nature 2014, Cell 2015, Cell Res. 2016, Cell 2017a, Cell 2017b, Mol. Cell 2017, Cell 2018, Mol. Cell 2019, Cell 2019)。

       該研究中,研究人員通過(guò)生化實(shí)驗發(fā)現AcrIIC2和Nme1Cas9結合后,可以抑制sgRNA(由crRNA和tracrRNA融合而成)的結合,從而使Nme1Cas9的功能被抑制。研究人員隨后解析了2.45埃的apo狀態(tài)AcrIIC2晶體結構。結構發(fā)現AcrIIC2應該是一個(gè)dimer。兩個(gè)AcrIIC2結合形成一個(gè)帶負電荷的口袋,這提示AcrIIC2可能和帶正電荷的BH domain結合,從而發(fā)揮抑制功能。研究人員將復合物Nme1Cas9-AcrIIC2用蛋白酶預處理,收到了分辨率高達2.28埃的晶體衍射數據。解出來(lái)AcrIIC2 與Nme1Cas B H復合物結構;功能實(shí)驗進(jìn)一步驗證AcrIIC2和sgRNA競爭性地結合Nme1Cas9 BH 結構域。

       王艷麗和Karen Maxwell為論文的共同通訊作者。Karen Maxwell課題組的Annoj Thavalingam、Bianca Garcia,王艷麗課題組的博士生程志、黃雪為論文的共同第一作者。該研究得到科技部、國家自然科學(xué)基金以及中科院的資助,上海同步輻射光源(SSRF)為該研究提供了重要的技術(shù)支持。

       

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