基因融合(Fusion gene),由兩個(gè)不同的基因異常結合而引起的,在癌癥的發(fā)生過(guò)程中起著(zhù)重要的作用。通常,它們被用作為預測特定癌癥患者藥物反應以及預后的診斷工具,以評估患者的治療結果。它們也是一些最新癌癥治療的重要藥物靶點(diǎn)。
到目前為止,研究人員已經(jīng)確定了大約20,000個(gè)基因融合,但是它們在發(fā)展癌癥中的確切功能和作用我們仍然知之甚少。因此,區分基因融合是否對癌癥存活有影響,具有重要的臨床意義。
近日,《Nature Communications》雜志上刊載了一篇關(guān)于基因融合的最新研究。研究人員利用CRISPR基因編輯技術(shù), 揭示了能夠對癌細胞生長(cháng)起到至關(guān)重要作用的基因融合類(lèi)型,并且發(fā)現了一種新的基因融合,可以為包括腦癌和卵巢癌在內的多種癌癥提供新的藥物靶點(diǎn)。
首次基因融合的大規模研究
作為對基因融合功能的首次大規模研究, Wellcome Sanger研究所聯(lián)合EMBL-EBI研究所、 Open Targets平臺、GSK公司及其合作者共同分析了來(lái)自43種不同癌癥類(lèi)型(包括兒科癌癥和臨床需求未得到滿(mǎn)足的癌癥)的1,000多種人類(lèi)癌細胞系中的8000多種基因融合。
之后,他們利用350多種抗癌藥物來(lái)對這些細胞系進(jìn)行測試,以確定現有的可以用于治療潛在基因融合相關(guān)癌癥的藥物,并利用CRISPR工具來(lái)尋找哪些關(guān)鍵基因融合對癌細胞的存活至關(guān)重要。
研究小組發(fā)現,90%的基因融合在癌癥中并不起重要作用,但當從病人腫瘤的基因組序列推斷癌癥的原因時(shí),這些結果應該被考慮。第一作者、Wellcome Sanger研究所的Gabriele Picco博士說(shuō):“隨著(zhù)對患者的腫瘤進(jìn)行基因組測序變得更普遍,那些對于數據進(jìn)行解讀的人必須要更加小心,需要考慮是否存在特定基因融合驅動(dòng)了癌癥的發(fā)展。
Wellcome Sanger研究所和Open Targets平臺的Mathew Garnett博士表示:“我們還發(fā)現了對癌癥存活發(fā)揮關(guān)鍵作用的一些基因融合。這些基因變化可能為現有藥物治療患者帶來(lái)新的機會(huì ),也可能會(huì )成為未來(lái)新的藥物靶點(diǎn)。目前,我們發(fā)現了一種新的基因融合——YAP1-MAML2,它為包括卵巢癌在內的幾種癌癥提供了一種新的藥物靶點(diǎn)。”
研究結果還表明,包括RAF1、ROS1和BRD4的基因融合體均可能是現有藥物的靶向。這意味著(zhù),患有罕見(jiàn)亞型胰 腺癌,乳腺癌和肺癌的患者將擁有新的治療
海德堡大學(xué)的Julio Saez-Rodriguez博士對此結果十分感興趣。他說(shuō),這項研究有助于進(jìn)一步利用基因融合體作為治療性生物標記,并將患者分類(lèi)進(jìn)行臨床試驗,促進(jìn)更有針對性和更高效的臨床研究方法。
今后,Sanger,EMBL-EBI和Open Targets以及 GSK的研究人員將合作促進(jìn)這些研究成果轉化,為新的治療方法帶來(lái)契機。這一研究有助力于建立癌癥依賴(lài)性地圖,以及形成未來(lái)癌癥精確治療方案。
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