上周《科學(xué)轉化醫學(xué)》雜志發(fā)表一篇奎寧作用機理的文章。這個(gè)工作利用質(zhì)譜加細胞內熱遷移(MS-CETSA)技術(shù)分析奎寧和甲氟喹對瘧原蟲(chóng)蛋白組中蛋白的穩定作用。作者首先用葉酸受體拮抗劑乙胺嘧啶和一個(gè)叫做E64d的蛋白酶驗證了MS-CETSA在這個(gè)系統的可行性,然后發(fā)現一個(gè)叫做嘌呤核苷磷酸化酶(PfPNP)的蛋白是與奎寧和甲氟喹作用的生物靶點(diǎn)。作者制造了重組PfPNP,證明奎寧以高強度(nM)與其催化結合腔結合、并得到二者復合物的晶體結構。
解析
瘧疾是熱帶、亞熱帶地區的主要流行病,現在每年還有50萬(wàn)人死于這個(gè)疾病,中國科學(xué)家發(fā)現的青蒿素是支柱療法。但隨著(zhù)傳染這個(gè)疾病的蚊子對殺蟲(chóng)劑的耐藥和瘧原蟲(chóng)對標準抗瘧藥物的耐藥,瘧疾有反彈的趨勢,所以未來(lái)可能需要新型抗瘧藥物或組合。但多數抗瘧藥物都是通過(guò)表型或臨床研究發(fā)現、分子機理未知,這令理性組合缺少根據??鼘庮?lèi)藥物是的一類(lèi)抗瘧藥物,一般認為與血紅素解毒有關(guān)。但分子機理非常模糊,最近有研究顯示甲氟喹可能與核糖體結合,而奎寧本身靶點(diǎn)蛋白此前未知。
CETSA是近年興起的一個(gè)無(wú)需探針的靶點(diǎn)鑒定技術(shù)。其工作原理是小分子配體與蛋白結合后通常會(huì )令這個(gè)蛋白熱穩定性增加,所以藥物處理的整體細胞或打碎細胞受到梯度加熱會(huì )逐漸令蛋白變性。在特定溫度下只有穩定的蛋白存在于溶液中、可以用質(zhì)譜鑒定。這個(gè)技術(shù)可以?huà)呙璐蟛糠挚扇苄缘鞍捉M(太大蛋白不行),所以對于尋找機理未知藥物的生物靶點(diǎn)非常有用。這個(gè)技術(shù)另一個(gè)更常見(jiàn)用途是驗證你正在優(yōu)化的化合物在細胞環(huán)境下確實(shí)與目標靶點(diǎn)結合,以避免優(yōu)化脫靶活性。這個(gè)技術(shù)的一個(gè)缺點(diǎn)是如果干擾天然蛋白復合物會(huì )令部分蛋白穩定性下降,事實(shí)上經(jīng)常觀(guān)測到化合物會(huì )令很多蛋白熔點(diǎn)下降。甚至針對同一靶點(diǎn)蛋白的化合物中也會(huì )有部分化合物增加穩定性、而同系物降低穩定性的情況。
雖然17世紀就有使用奎寧的記載,但直到80年代才有耐藥人群出現,這說(shuō)明奎寧可能調控多條生物途徑。雖然奎寧和甲氟喹的CETSA活性類(lèi)似,但在純化PfPNP的活性差一千倍、而羥氯喹根本沒(méi)活性。這也說(shuō)明PfPNP不一定是奎寧唯一機理,在治療濃度下還有其它機制。耐藥與一個(gè)叫做pfmdr1的膜轉運蛋白拷貝數正相關(guān),所以奎寧靶點(diǎn)可能在細胞內、這是本文作者重點(diǎn)關(guān)注的地方。雖然此前業(yè)界不知PfPNP是奎寧的分子靶點(diǎn),但根據生物學(xué)信息PfPNP也成為一個(gè)正在開(kāi)發(fā)的抗瘧靶點(diǎn)。不過(guò)其它PfPNP抑制劑雖然在某些動(dòng)物模型有效,但在某些模型無(wú)效。另外宿主細胞也有多種類(lèi)似蛋白存在,令這個(gè)靶點(diǎn)的重要性受到質(zhì)疑。
已經(jīng)用了五百年的老藥用現代高科技還無(wú)法高清其全部機理,可以想象即使在今天的技術(shù)支持下從頭理性設計出奎寧、青蒿素這樣的有效抗瘧藥也不是一件容易的事情。不僅這些天然產(chǎn)物的藥理非常復雜、合成也非常困難,如果不是天然存在幾乎沒(méi)有可能出現在篩選化合物庫中。人類(lèi)在沒(méi)有現代科學(xué)的時(shí)代發(fā)現奎寧的治瘧療效得益于瘧疾流行的熱帶也盛產(chǎn)富含奎寧的金雞納樹(shù)(奎寧也叫金雞納霜),另一個(gè)百年老藥水楊酸來(lái)自柳樹(shù)皮,而柳樹(shù)多生長(cháng)在易發(fā)關(guān)節炎的濕熱地帶。這種天然產(chǎn)物與其治療疾病的天人合一令不懂化學(xué)、生物的古人僅憑神農嘗百草的粗暴方式也能比較容易找到一些藥物。上帝關(guān)上一扇門(mén)但同時(shí)打開(kāi)一扇窗,令人類(lèi)得以繁衍生息。
用了幾百年的奎寧現在機理還是一地雞毛說(shuō)明理性藥物設計的復雜和粗糙,當然即使少量臨床數據就可以大大簡(jiǎn)化臨床前的胡猜亂想。遺憾的是因為倫理原因現在神農已經(jīng)不能隨便嘗百草,現在得到這個(gè)信息只能深度挖掘人體基因學(xué)數據。如果沒(méi)有人體基因學(xué)數據,繼續發(fā)明CETSA這樣高科技是增強設計邏輯的唯一出路。
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