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AJHG:給新生兒做基因測序 美國人已經(jīng)這樣做了

熱門(mén)推薦: BRCA2突變 基因變異 基因測序
作者:陳莫伊  來(lái)源:生物探索
  2019-01-08
大部分嬰兒在出生時(shí)要接受足跟血篩查等檢測,以診斷某些疾病,如苯丙酮尿癥、先天性甲狀腺功能低下等。然而,這種生化檢測能夠適用的疾病種類(lèi)并不全面。

       大部分嬰兒在出生時(shí)要接受足跟血篩查等檢測,以診斷某些疾病,如苯丙酮尿癥、先天性甲狀腺功能低下等。然而,這種生化檢測能夠適用的疾病種類(lèi)并不全面。

       如何克服這一局限性?新生兒測序或許是個(gè)辦法。

       近日,一組科學(xué)家在《美國人類(lèi)遺傳學(xué)雜志》(AJHG)雜志上報告稱(chēng),他們對127名健康新生兒以及32名患病新生兒進(jìn)行了外顯子組測序,發(fā)現了15名攜帶基因變異的嬰兒。這些基因變異會(huì )使新生兒具有患病風(fēng)險,而這類(lèi)風(fēng)險是傳統篩查無(wú)法檢測到的。

       新生兒測序計劃

       該研究是名為“新生兒測序計劃”(BabySeq)的項目的一部分。5年前,美國國立衛生研究院(NIH)資助了包括BabySeq在內的4個(gè)項目,旨在探索基因組測序在新生兒篩查中的應用。

       BabySeq是首個(gè)對新生兒進(jìn)行測序的隨機試驗,由布萊根婦女醫院和波士頓兒童醫院的研究人員聯(lián)合發(fā)起,貝勒醫學(xué)院的研究人員也參與其中。

       參與試驗的268個(gè)家庭都面見(jiàn)了一位遺傳顧問(wèn),目的是討論一般的家族史。之后,超過(guò)一半的家庭對新生兒進(jìn)行了全外顯子組測序,并利用Sanger測序驗證了所有變異。

       領(lǐng)導該研究的臨床分子遺傳學(xué)家Ozge Cehan-Birsoy和她的團隊查看這些測序信息后會(huì )撰寫(xiě)一份臨床報告,然后交給新生兒的家庭,放進(jìn)他們的醫療記錄,供兒科醫生使用。

       在報告中,Cehan-Birsoy等提供了指示患兒童疾病任何風(fēng)險的信息,以及與兒童用藥副作用相關(guān)的基因突變。此外,研究人員還讓參與試驗的新生兒父母選擇,是否需要了解與成人疾病發(fā)病風(fēng)險相關(guān)的基因變異,如BRCA1 和BRCA2。

       基因測序發(fā)現了什么

       具體來(lái)說(shuō),研究顯示,接受測序的159名嬰兒中,有15人攜帶與患兒童疾病風(fēng)險相關(guān)的基因變異。這些變異與多種疾病有關(guān),包括幾種心臟?。ㄈ鐢U張型或肥厚型心肌病、瓣上主動(dòng)脈瓣狹窄)、生物素代謝酶缺乏以及聽(tīng)力喪失。

       其中,攜帶與生物素代謝酶缺乏相關(guān)突變的新生兒經(jīng)進(jìn)一步檢測,確認患有部分生物素酶缺乏癥(Biotinidase Deficiency,一種罕見(jiàn)?。?,這種疾病會(huì )導致皮疹、脫發(fā)和癲癇發(fā)作。目前,該患兒的飲食中正在添加生物素,有望預防這類(lèi)疾病的臨床表現。

       此外,有2名嬰兒的基因組中含有與癌癥相關(guān)的BRCA2突變,其中一名嬰兒的母親具有乳腺癌家族史。有8名嬰兒攜帶與藥物不良反應相關(guān)的基因突變。

       測序的價(jià)值“仍未知”

       BabySeq的項目發(fā)起人之一、波士頓兒童醫院的遺傳學(xué)家Alan Beggs表示,目前來(lái)說(shuō),他們面對的一個(gè)難題是:大部分他們發(fā)現的基因變異都與新生兒目前所患的任何疾病沒(méi)有關(guān)系。那么,這些基因變異究竟會(huì )如何影響孩子呢?盡管這類(lèi)基因信息可能有一定的預測價(jià)值,但它不是確定的。孩子們在未來(lái)不會(huì )患任何相關(guān)的疾病也是有可能的。

       此外,他還表示,盡管新生兒基因測序可能會(huì )帶來(lái)有益的、甚至是救命的影響,但也會(huì )讓孩子的父母感到不安。究竟測序篩查帶來(lái)的經(jīng)濟壓力和家庭心理壓力,與其帶來(lái)的好處之間會(huì )是怎樣一個(gè)平衡?這是BabySeq項目真正想要尋找的答案。而時(shí)間將回答這一問(wèn)題。

       北卡羅來(lái)納大學(xué)教堂山分校的兒科醫生、遺傳學(xué)家Cynthia Powell對此表示認同,她希望研究人員能夠長(cháng)期跟蹤接受測序的新生兒,以了解他們之后患病的情況。盡管如此,Powell仍認為,這項研究提供了相當有說(shuō)服力的證據,證明基因組測序是有幫助的。

       然而,盡管測序能夠提供更多關(guān)于新生兒的信息,但全面推廣還有很多阻礙。一方面,據估計,臨床外顯子組測序可能會(huì )花費每人幾千美元;相比之下,新生兒足跟血篩查以及血液檢測最多需要幾百美元。另一方面,外顯子組測序是否會(huì )給嬰兒帶來(lái)更好的結果還有待觀(guān)察。此外,對基因數據正確、全面的解讀也是一大未解的難題。

       寫(xiě)在最后

       近年來(lái),隨著(zhù)測序技術(shù)在臨床應用中越來(lái)越普遍,我們似乎正邁向“基因組醫學(xué)時(shí)代”。未來(lái),不僅測序成本會(huì )進(jìn)一步降低,對基因數據的解讀也必定會(huì )更加更熟。每個(gè)人的基因信息將變得越來(lái)越重要。

       盡管這一趨勢明顯,但美國的這項新生兒測序計劃進(jìn)展地并不是非常順利。2016年,Science曾報道,愿意加入該項目的家庭占受邀家庭的比例不到10%。那么,給你的新生兒做個(gè)測序,你愿意嗎?

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