自1882年環(huán)丙烷環(huán)被合成以來(lái),環(huán)丙基以其特有的性質(zhì),在藥物化學(xué)中不斷地被廣泛使用,目前,在FDA批準的上市藥物中,含有環(huán)丙基的藥物分子有60多個(gè)。環(huán)丙烷的結構特點(diǎn)有:1,三個(gè)碳原子在同一個(gè)平面;2,相對較短的C-C鍵長(cháng);3,環(huán)丙基的C-C鍵不是單純的單鍵或雙鍵,而是在介于二種鍵之間,有類(lèi)似于雙鍵的性質(zhì);4,環(huán)丙基中的C-C鍵比直鏈烷烴的C-C鍵的化學(xué)活性要高,鍵長(cháng)更短,鍵能更高。
1.替代雙鍵(HCV NS5B 非核苷類(lèi)抑制劑42)
Gentles和他的同事們以化合物41為先導化合物進(jìn)行藥物結構優(yōu)化。他們優(yōu)化出的化合物42(BMS-791325)具有很多方面的優(yōu)點(diǎn),比如1:在大環(huán)結構中引入了剛性結構,使化合物42的構象趨于穩定;2:環(huán)丙基與HCV NS5B聚合酶的殘基高效的相互作用;3:消除了潛在的邁克爾受體(雙鍵)的反應性能。一般說(shuō)來(lái),環(huán)丙基類(lèi)似物的效力大于烯烴類(lèi)似物,這可能是由于環(huán)丙基與Leu492(PDB ID 4NLD)的羰基氧骨架相互作用的結果。這些研究最終導致發(fā)現了臨床候選化合物42,目前該化合物正在進(jìn)行臨床3期試驗。
2.引入螺環(huán)結構(GS-5885)
吉利德公司在開(kāi)發(fā)HCV NS5A抑制劑過(guò)程中,發(fā)現了活性較好的化合物39,后續優(yōu)化中插入螺環(huán)-環(huán)丙基吡咯烷環(huán)來(lái)取代吡咯烷環(huán),從而產(chǎn)生最有效的HCV NS5A抑制劑化合物40。因此,螺環(huán)丙基取代基不僅對增強藥效和改善蛋白質(zhì)調節有重要作用,同時(shí)也優(yōu)化了PK性質(zhì)。
3.引入稠環(huán)結構(GEN-4997)
基因泰克公司的研究人員首先發(fā)現了化合物68(GNE-9822),發(fā)現其對hERG鉀離子通道有明顯的抑制作用,但副作用較大。在后續優(yōu)化中,研究人員發(fā)現了化合物69,其對ITK酶活性有很好的抑制作用,但是化合物69與附近的親脂口袋之間的相互作用不夠強,通過(guò)對化合物69的四氫吲唑骨架進(jìn)行改造,插入雙氟代環(huán)丙基得到化合物70(GNE-4997),極大的提高了化合物的生物活性。X射線(xiàn)共晶結構可顯示環(huán)丙基的二氟乙烯部分與親脂口袋的有效空間填充。
4.構象受限組胺類(lèi)似物的設計
組胺和其他神經(jīng)遞質(zhì)一樣,具有多種構象,這可能使其通過(guò)不同構象與多種受體亞型結合成為可能。例如,與H3受體結合的構象,即,H3亞型的生物活性構象可能不同于H1、H2和/或H4亞型受體。同樣,H4亞型的生物活性構象可能與其他受體亞型不同。因此,由于組胺構象的限制可能改善對受體亞型之一的特異性結合,通過(guò)限制組胺構象來(lái)開(kāi)發(fā)新的H3選擇性激動(dòng)劑。
Shotu及其研究人員在咪唑側鏈上引入環(huán)丙基,設計了大量的構象限制組胺類(lèi)似物,實(shí)驗活性測試發(fā)現化合物13具有選擇性的H3受體激動(dòng)劑,但是對H4受體則無(wú)激動(dòng)效應。這些研究表明環(huán)丙基的構象限制策略是一個(gè)很好地方法。
5.惡唑烷酮的環(huán)丙基取代
利奈唑胺(下圖1)和依哌唑胺(下圖2)是廣譜抗菌類(lèi)藥物,Renslo及其研究人員對C環(huán)進(jìn)行優(yōu)化,引入環(huán)丙基從而改善該類(lèi)藥物的活性,研究發(fā)現環(huán)丙并環(huán)戊胺的改變,具有了芳雜環(huán)的一些特性,使該類(lèi)化合物對大多數革蘭氏陽(yáng)性及革蘭氏陰性菌都有良好的抑制作用。
當然,環(huán)丙基在藥物化學(xué)中的其他應用還有很多,比如在J. Med.Chem. 2008, 51, 6581?6591中用環(huán)丙基取代乙基,大大提高了分子的生物利用度;在Bioorg. Med. Chem.Lett. 2003, 13, 4007?4010中用環(huán)丙基取代苯環(huán),降低了分子的親脂性,得到了更優(yōu)的Lck靶點(diǎn)的抑制劑。
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