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單細胞RNA性能分析新方法

熱門(mén)推薦: 單細胞 RNA 編碼蛋白
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  2018-08-27
人體由130億個(gè)細胞按不同功能、分門(mén)別類(lèi)順序組成,每個(gè)細胞都有其獨特的分子“指紋”,即使是坐落于同一族群之中的細胞也可以彼此不同。并且它們的活動(dòng)也會(huì )隨時(shí)間變化。

       人體由130億個(gè)細胞按不同功能、分門(mén)別類(lèi)順序組成,每個(gè)細胞都有其獨特的分子“指紋”,即使是坐落于同一族群之中的細胞也可以彼此不同。并且它們的活動(dòng)也會(huì )隨時(shí)間變化。單細胞分析工具的應運而生就是為了解決細胞-細胞間非均質(zhì)的復雜機制。正如德國慕尼黑大學(xué)(LMU)分子生物學(xué)家Wolfgang Enard教授在他們新發(fā)表的論文寫(xiě)道“單細胞技術(shù)對生命科學(xué)來(lái)說(shuō)是一場(chǎng)變革,”他的課題組利用這項技術(shù)最近剛在《Molecular Cell》發(fā)表了一篇文章。

       mRNA是細胞用于將DNA遺傳信息轉化為編碼蛋白的轉錄本,它們是核糖體構建細胞實(shí)體的基本藍圖。因此,每個(gè)細胞的mRNA列表相當于該細胞正在合成的蛋白質(zhì)列表,可以提示細胞當時(shí)的功能和狀態(tài)。通過(guò)鑒定當時(shí)處于活躍的基因,也可以從側面反映基因是被如何調控的,特別是在疾病或感染等特殊時(shí)期。

       測序單個(gè)細胞內所有mRNA是一項艱巨的任務(wù),具體實(shí)施涉及幾種不同方法。一切方法需要先始于利用逆轉錄酶將分離的mRNAs反轉錄為DNA,然后擴增DNA拷貝進(jìn)行序列分析。Enard和同事系統地修改了其中一種方法,scRNA-seq(單細胞RNA條形碼測序),顯著(zhù)提高了這項技術(shù)的靈敏度。“訣竅是補充和提高逆轉錄酶反應試劑的稠度,使更多RNA分子轉錄成DNA鏈,”Enard解釋。“稠度上升導致分子擁擠,加速反應。”第二個(gè)改進(jìn)是減少某些優(yōu)先DNA擴增的發(fā)生率,這些物質(zhì)會(huì )扭曲原始RNA表達。

       單細胞測序方法對實(shí)現人類(lèi)細胞地圖(Human Cell Atlas)是必不可少的。Enard的目標是使他們的新技術(shù)加入人類(lèi)細胞地圖國際項目,該項目的規模與人類(lèi)基因組計劃相當。它的目標是根據特定的基因活動(dòng)模式,組裝所有人類(lèi)細胞類(lèi)型目錄。該項目將極大地擴大我們對人類(lèi)生物學(xué)和人類(lèi)疾病起源的認識。

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