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CPHI制藥在線(xiàn) 資訊 研究發(fā)現基因逃離著(zhù)絲粒區域的進(jìn)化趨勢

研究發(fā)現基因逃離著(zhù)絲粒區域的進(jìn)化趨勢

來(lái)源:遺傳發(fā)育所
  2018-07-13
中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陳明生研究組,在完成短花藥野生稻全基因組測序的基礎上,利用BAC測序和物理圖譜等信息,完善了短花藥野生稻十二條染色體著(zhù)絲粒和近著(zhù)絲粒區域的序列。

       著(zhù)絲粒及其周邊是植物基因組中進(jìn)化最快、結構最復雜的區域。著(zhù)絲粒與近著(zhù)絲粒區域不僅經(jīng)歷著(zhù)快速的序列變化與結構重塑,而且具有轉錄活性的基因,也是新基因起源的熱點(diǎn)區。

       中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陳明生研究組,在完成短花藥野生稻全基因組測序的基礎上,利用BAC測序和物理圖譜等信息,完善了短花藥野生稻十二條染色體著(zhù)絲粒和近著(zhù)絲粒區域的序列。并在此基礎上開(kāi)展了稻屬及其禾本科植物著(zhù)絲粒區域的比較基因組學(xué)研究。研究發(fā)現:短花藥野生稻獨立選擇與適應了特異的著(zhù)絲粒序列;近著(zhù)絲粒的倒位是著(zhù)絲粒位置發(fā)生移動(dòng)的主要方式;短花藥野生稻第十二號著(zhù)絲粒的位置移動(dòng)是一個(gè)典型的著(zhù)絲粒重定位現象,新著(zhù)絲粒起源于舊著(zhù)絲粒區域的一個(gè)區段性重復;著(zhù)絲粒區域或周邊的基因通過(guò)基因重復后的選擇性刪除,出現基因逃離著(zhù)絲粒環(huán)境的進(jìn)化趨勢,這種進(jìn)化動(dòng)力一方面來(lái)自著(zhù)絲粒區域遺傳與表觀(guān)遺傳環(huán)境對基因的不利影響,另外一方面也可能與著(zhù)絲粒的擴展有關(guān);同時(shí)發(fā)現水稻近著(zhù)絲粒區域在近期進(jìn)化過(guò)程中形成了大量的新基因。

       這項研究成果于7月2日在線(xiàn)發(fā)表于The Plant Cell雜志(DOI:10.1105/tpc.18.00163)。陳明生研究組博士廖毅和張雪梅為論文的共同第一作者。該研究得到了國家自然科學(xué)基金的資助。

       

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